胃鏡檢查現在已經作為上消化道幾乎所有疾病的發現和診斷的金標準，特別是能提高早期胃癌、食管癌的發現率。同時在胃鏡下也可做治療，這樣對病人的幫助就非常大。但是對于胃鏡的認識，不少人還存在一些誤區，對胃鏡檢查感到懼怕
誤區一、呼氣試驗能替代胃鏡，隨著幽門螺桿菌感染在胃十二指腸疾病發病中作用認識的統一，不少醫療單位開展了檢測幽門螺桿菌感染的呼氣試驗。但一些不恰當的宣傳，如“輕輕吹口氣，就能查胃病”誤導了不少病人。呼氣試驗的作用僅僅是檢測幽門螺桿菌感染。呼氣試驗陰性不等于沒有胃病，事實上部分慢性淺表性胃炎、萎縮性胃炎、胃潰瘍、十二指腸潰瘍或胃癌可以沒有幽門螺桿菌感染，或由于服用了某些藥物影響幽門螺桿菌的檢測，出現假陰性。呼氣試驗陽性也不能夠判斷是何種胃病。因此呼氣試驗不能替代胃鏡檢查，要知道患何種胃病，需要胃鏡檢查。
誤區二、胃鏡檢查很痛苦，有消化不良癥狀的病人到醫院就診時，醫生往往會要求病人進行胃鏡檢查。一些病人因害怕胃鏡檢查會有痛苦，而猶豫不決。事實上，隨著胃鏡鏡子質量的不斷提高（更細、更軟，操控性更好）和操作醫生技術的不斷熟練，半數以上病人接受胃鏡檢查時僅有輕度不適感。一般熟練醫生在3-5分鐘內即可完成胃鏡檢查（包括拍照、取活檢等操作），遇到復雜病人也很少超過10分鐘。因此多數病人是能夠承受的。胃鏡檢查一般不會產生疼痛，主要不適是惡心和感覺到呼不出氣。由于病人的恐懼心理和胃鏡通過咽部插入食管時的反射，多數病人會有暫時憋氣，這就像一個不會游泳的人掉在水里一樣，會不自主憋氣。當病人實在憋不住后才呼氣，就會出現惡心。因此胃鏡檢查時病人不憋氣和調勻呼吸是關鍵。由熟練的醫生進行胃鏡操作，檢查時病人的不適程度主要由病人因素所決定，一般高度恐懼、中青年、男性、體型較胖、吸煙、刷牙容易惡心的病人，胃鏡檢查時反應較大，不適程度高。這些病人可通過使用鎮靜藥物使他們處于無意識狀態而消除檢查時的不適，即可采用“無痛”胃鏡檢查。
誤區三、胃鏡檢查會加重出血，上消化道出血是胃鏡檢查的指征之一，但當醫生動員病人做胃鏡檢查時，部分病人和家屬會有顧慮，擔心胃鏡檢查會加重出血。事實上這種顧慮是不必要的。胃鏡檢查在直視下進行，也就是說在直接看到食管、胃、十二指腸粘膜的情況下進行檢查，因此一般不會碰到病灶加重損害，除非是食管靜脈曲張破裂出血，病人配合不佳，劇烈惡心，間接造成出血。胃鏡檢查，特別是出血48小時內進行胃鏡檢查（稱為“急診胃鏡檢查”），在上消化道出血處理中有重要作用。第一，可明確上消化道出血病因，以便針對病因進行治療。由于糜爛等表淺病變在治療48小時后可能愈合，因此要強調及早做胃鏡。第二，可對活動性出血和可造成活動性出血的病灶進行胃鏡下止血。
誤區四、X光-鋇餐檢查可替代胃鏡，一些病人因害怕胃鏡檢查，要求用X-鋇餐檢查替代胃鏡檢查。其實胃鏡檢查與X-鋇餐檢查相比存在不少優點。首先胃鏡檢查在直視下進行，可直接看到食管、胃、十二指腸粘膜，可觀察到表淺的病變如胃粘膜表淺潰瘍、萎縮、糜爛、血管病變以及膽汁反流等。其次，胃鏡下可取胃粘膜活檢，這對胃粘膜萎縮、腸化、不典型增生和胃癌的確診是必須的，同時活檢標本還可作幽門螺桿菌檢測。胃鏡檢查中的這些發現對胃病的治療有很大幫助，因此多數情況下X-鋇餐檢查不能替代胃鏡檢查。
誤區五、年輕人不需要做胃鏡，年輕人胃病是否需要胃鏡檢查取決于病人癥狀、當地胃癌發病率和治療后的療效。當病人有報警癥狀包括消化道出血或貧血、吞咽困難、消瘦或反復嘔吐等，不論年齡大小，都需要做胃鏡檢查。有其他消化不良癥狀者是否立即行胃鏡檢查，取決于當地胃癌發病率。胃癌發病率很低的國家或地區，如美國將立即進行胃鏡檢查的年齡界限定為55歲，多數國家定為45歲。當然，一些治療效果不佳的年輕病人也需要做胃鏡檢查，以明確病情，針對疾病治療。由于胃癌病人不一定有報警癥狀，胃癌發病率相對較高，而胃鏡檢查費用相對較低，因此為了避免漏診胃癌，胃鏡檢查的指征應放寬，包括多數消化不良的年輕人也應該行胃鏡檢查。
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