 菏澤市立醫院始建于1946年，是一個有著光榮革命傳統的醫院。歷經77年的發展，市立醫院已成為我市集醫療、教學、科研、急救、預防、保健和技術指導于一體的綜合性三級甲等醫院，現為國家區域醫療中心建設單位、山東第一醫科大學附屬菏澤醫院，擔負著菏澤市七縣四區一千萬人民及鄰近省、市部分群眾的醫療保健任務。
醫院占地160畝，建筑總面積12.83萬平方米，現開放床位2185張。2022年完成門急診服務121.2萬人次，出院患者服務9.97萬人次，手術（不含操作）4.79萬臺次，全院共有職工3676人，其中衛生技術人員總人數3271人，占醫院職工總數的88.98%。博士研究生23人，碩士研究生993人。正高級職稱198人，副高級職稱688人，碩士生導師39人，住培指導醫師303人，責任導師236人。
醫院現設有40個臨床科室，23個醫技科室，35個職能科室，其中風濕免疫科、血液內科和臨床護理為山東省臨床重點專科（含建設單位），血液內科為省醫藥衛生重點學科和省醫療質量示范科室，急性缺血性卒中介入再通專科為山東省精品特色專科，乳腺甲狀腺外科和前列腺專科為市級臨床精品特色專科，29個專業為市級臨床重點專科。2021年國家績效考核等級為B++，在參評綜合醫院中排名第310名。
鄭州路腦科院區由市立醫院神經內科、神經外科、神經重癥、神經康復醫學科等多個優勢學科聯合整遷組建，開設神經內、外科、卒中、綜合內、外科等門診，設有醫學影像、檢驗、B超科等醫技科室。設有病區11個，開放床位400張。與北京宣武醫院、天壇醫院等知名醫院的專家團隊合作，積極提升醫院神經學科的診治水平，成功打造了以腦科院區為中心的卒中“1小時黃金救治圈”，推進醫院神經外科爭創國家級重點專科，同時建立了省級水平的纖維解剖訓練實驗室。
西安路院區正在建設集門診、急診、病房于一體的29.8萬平方米的綜合樓，完工后醫院建筑面積可達35萬平方米，停車位達到1740個，患者的就診和住院條件將得到極大改善。長江東路新院區于2020年底開工建設，總體規劃建筑面積約35萬平方米，分兩期實施，其中項目一期規劃用地面積約23.88萬㎡（約358.26畝），建筑面積約24.80萬㎡，床位數1500張，停車位1800個。功能模塊包括急診樓、門診樓、住院樓、醫技樓、保障系統用房等。二期規劃建筑面積約10萬平方米，規劃開放床位1500張，停車位1800個，項目按照三級甲等綜合醫院標準建設。
西安路醫院地址：山東省菏澤市牡丹區曹州路2888號
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病房服務管理部 0530-5613240
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醫保辦公室電話：0530-5613215
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腦科醫院地址：山東省菏澤市開發區鄭州路2號
腦科院區門診辦公室電話：0530-5377532
菏澤市立醫院體檢中心地址：山東省菏澤市西安路766號
體檢中心電話：0530-5927333
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